Polega na usunięciu z niej wszystkich kationów i anionów, które pochodzą od rozpuszczonych w niej soli.
Można ją zrealizować na drodze:
odwróconej osmozy
wymiany jonowej
elektrodejonizacji
Dobór metody zależy od ogólnej zawartości soli oraz zapotrzebowania na wodę. Całkowite usunięcie z wody praktycznie wszystkich rozpuszczonych substancji gwarantuje jedynie metoda wymiany jonowej.